Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML2Q9UQR0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCML2Q9UQR0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML2Q9UQR0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms