Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2BQ9UQN3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP2BQ9UQN3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms