Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC5Q9UQL6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC5Q9UQL6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms