Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCA2Q9UQC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLCA2Q9UQC9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms