Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PHF8Q9UPP1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PHF8Q9UPP1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms