Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM33Q9UPN9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms