Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1RE1Q9UN81 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms