Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PADI3Q9ULW8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PADI3Q9ULW8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PADI3Q9ULW8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PADI3Q9ULW8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PADI3Q9ULW8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI3Q9ULW8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI3Q9ULW8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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