Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNRF3Q9ULT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNRF3Q9ULT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms