Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALD1Q9ULE6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALD1Q9ULE6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PALD1Q9ULE6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms