Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB23Q9ULC3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB23Q9ULC3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms