Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMFRQ9UKV5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMFRQ9UKV5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1520.2 ms