Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCTPQ9UKL6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCTPQ9UKL6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCTPQ9UKL6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms