Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP8AP2Q9UKL3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CASP8AP2Q9UKL3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms