Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PARP4Q9UKK3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PARP4Q9UKK3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP4Q9UKK3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms