Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHIC2Q9UKJ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHIC2Q9UKJ5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CHIC2Q9UKJ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms