Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RCAN3Q9UKA8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RCAN3Q9UKA8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCAN3Q9UKA8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms