Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGA1Q9UJY5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGA1Q9UJY5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA1Q9UJY5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA1Q9UJY5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms