Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NUFIP1Q9UHK0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUFIP1Q9UHK0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUFIP1Q9UHK0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUFIP1Q9UHK0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUFIP1Q9UHK0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUFIP1Q9UHK0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUFIP1Q9UHK0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUFIP1Q9UHK0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms