Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHORDC1Q9UHD1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms