Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO40Q9UH90 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms