Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF20Q9UGU0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF20Q9UGU0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCF20Q9UGU0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms