Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT8Q9UFF9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms