Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CFDP1Q9UEE9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms