Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY0

SLC9A2, Sodium/hydrogen exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A2Q9UBY0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A2Q9UBY0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A2Q9UBY0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A2Q9UBY0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A2Q9UBY0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A2Q9UBY0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A2Q9UBY0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A2Q9UBY0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms