Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRPC4Q9UBN4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC4Q9UBN4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms