Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD2Q9UBB5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD2Q9UBB5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MBD2Q9UBB5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD2Q9UBB5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD2Q9UBB5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD2Q9UBB5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD2Q9UBB5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD2Q9UBB5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms