Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FRMD4AQ9P2Q2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FRMD4AQ9P2Q2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FRMD4AQ9P2Q2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms