Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH4Q9P2E8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH4Q9P2E8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms