Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N8

MARCH2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH2Q9P0N8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH2Q9P0N8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH2Q9P0N8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH2Q9P0N8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms