Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCKIPSDQ9NZQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKIPSDQ9NZQ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms