Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ARHGEF12Q9NZN5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ARHGEF12Q9NZN5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms