Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EHD3Q9NZN3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.33■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms