Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf78Q9NZ63 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C9orf78Q9NZ63 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
C9orf78Q9NZ63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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