Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GGA3Q9NZ52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms