Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH8Q9NYR8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH8Q9NYR8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms