Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTMR4Q9NYA4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTMR4Q9NYA4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR4Q9NYA4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms