Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A12Q9NXJ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms