Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms