Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OXSMQ9NWU1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms