Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT6Q9NWK9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms