Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW07

ZNF358, Zinc finger protein 358, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF358Q9NW07 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF358Q9NW07 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms