Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT84Q9NSB2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT84Q9NSB2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms