Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNBIP1Q9NSA3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms