Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS45Q9NRW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms