Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF4Q9NR80 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF4Q9NR80 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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