Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CD163L1Q9NR16 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CD163L1Q9NR16 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms