Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GPHNQ9NQX3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms