Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED4Q9NPJ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms