Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHS2Q9NP85 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms